Course information

LABORATORIO 1 Introducción al laboratorio, reglas y normas de seguridad, discusión de los criterios de evaluación del laboratorio.  Repaso técnicas asépticas y transferencias y dilución seriada.  Asignar a los estudiantes la búsqueda y lectura de Mony C, Vandenkoornhuyse P, Bohannan BJM, Peay K and Leibold MA (2020) A landscape of opportunities for microbial ecology research. Front. Microbiol. 11:561427.

LABORATORIO 2 Introducción a la ecología microbiana y al uso de medidas de tendencia central: porciento, frecuencia relativa, ANOVA, medidas de resumen, media, mediana, rango y desviación estándar.  Relevancia del Teorema del Límite Central en estudios de ecología microbiana.  Principios de estadística aplicada a la enumeración bacteriana: Número Más Probable.  Preparación de gráficas para presentar resultados.  Repaso de tinciones simples y diferenciales. (Informe #1)

LABORATORIO 3 Parámetros fisicoquímicos: determinar pH, D.O., temperatura, salinidad, tipo de nutrientes en diversos tipos de ambientes.  Aspectos relevantes de los diferentes tipos de suelo en las comunidades microbianas con respecto a los factores fisicoquímicos que caracterizan los suelos. Calcular productividad primaria.

LABORATORIO 4 Sucesión microbiana (Parte I): Queso, columna Winogradsky, laminilla enterrada y cámara húmeda de excremento de herbívoros.

LABORATORIO 5 Explorando la baja atmósfera: Exposición de platos Petri para observar diversidad de microorganismos.  Uso de muestreadores volumétricos para capturar particulado biológico: Air-O-Cell vs Andersen Sampler. (Informe #2)

Entrega del Primer Informe de Laboratorio.

EXAMEN #1 cubre Laboratorios 1-5

LABORATORIO 6 Componentes vivos de la litosfera (Parte I). Rizosfera: como los microorganismos cooperan para mantener saludables las raíces de las plantas.  Extracción de suelo para observar hongos micorrízicos, protistas, bacterias, microinvertebrados y nematodos.  Tinción de raíces.

LABORATORIO 7 Componentes vivos de la litosfera (Parte II).  Aislamiento de endófitos para determinar diversidad de hongos y bacterias.

LABORATORIO 8 Comunidades microbianas en la hidrosfera (Parte I).  Análisis de la columna de agua y espuma en ecosistemas acuáticos. Aplicación de la citometría de flujo al estudio de comunidades de microorganismos acuáticos (demostración).

LABORATORIO 9 Comunidades microbianas en la hidrosfera (Parte II). Análisis de sedimentos en el agua para observar hongos, protistas, bacterias, cianobacterias y micro-invertebrados.

Entrega del Segundo Informe de Laboratorio.

LABORATORIO 10 Sucesión microbiana (Parte II) Se terminarán de colectar datos de la columna Winogradsky, la laminilla enterrada y las cámaras húmedas de excremento de herbívoros.  Metagenómica y genética para el estudio de las comunidades microbianas.

EXAMEN #2 cubre Laboratorios 6-10, Entrega de Carpeta de Laboratorio